第三十八條
（刪除）

第四十條（罰則）
事業或污水下水道系統排放廢（污）水，違反第七條第一項或第八條規定者，處新臺幣六萬 元以上二千萬元以下罰鍰，並通知限期改善，屆期仍未完成改善者，按次處罰；情節重大者 ，得令其停工或停業；必要時，並得廢止其水污染防治許可證（文件）或勒令歇業。 畜牧業違反第七條第一項或第八條之規定者，處新臺幣六千元以上六十萬元以下罰鍰，並通 知限期改善，屆期仍未完成改善者，按次處罰；情節重大者，得令其停工或停業；必要時， 並得廢止其水污染防治許可證（文件）或勒令歇業。

第四十三條（罰則）
事業或污水下水道系統違反依第九條第二項所定之總量管制方式者，處新臺幣三萬元以上三 百萬元以下罰鍰，並通知限期改善，屆期仍未完成改善者，按次處罰；情節重大者，得令其 停工或停業，必要時，並得廢止其水污染防治許可證（文件）或勒令歇業。

第五十條（罰則）
規避、妨礙或拒絕第二十六條第一項之查證者，處新臺幣三萬元以上三百萬元以下罰鍰，並 得按次處罰及強制執行查證工作。