本法所稱主管機關：在中央為行政院環境保護署；在直轄市為直轄市政府 ；在縣 (市) 為縣 (市) 政府。

中央、直轄市、縣 (市) 主管機關得指定或委託專責機構，辦理水污染研 究、訓練及防治之有關事宜。

中央主管機關應依水體特質及其所在地之情況，劃定水區，訂定水體分類 及水質標準。 前項之水區劃定、水體分類及水質標準，中央主管機關得交直轄市、縣 ( 市) 主管機關為之。 劃定水區應由主管機關會商水體用途相關單位訂定之。

事業、污水下水道系統或建築物污水處理設施，排放廢 (污) 水於地面水 體者，應符合放流水標準。 前項放流水標準，由中央主管機關會商相關目的事業主管機關定之。直轄 市、縣 (市) 主管機關得視轄區內環境特殊或需特予保護之水體，擬訂個 別較嚴之放流水標準，報請中央主管機關會商相關目的事業主管機關後核 定之。

水體之全部或部分，有左列情形之一，直轄市、縣 (市) 主管機關應依該 水體之涵容能力，以廢 (污) 水排放之總量管制方式管制之： 一 因事業密集，以放流水標準管制，仍未能達到該水體之水質標準者。 二 需特予保護者。 前項總量管制方式，由直轄市、縣 (市) 主管機關擬訂，報請中央主管機 關會商相關目的事業主管機關後核定之；其涉及二直轄市、縣 (市) 者， 由中央主管機關會商相關目的事業主管機關定之。

事業於設立或變更前，應先檢具水污染防治措施計畫，經直轄市、縣 (市 ) 主管機關審查核准，始得向目的事業主管機關申請設立或變更。

事業排放廢 (污) 水於地面水體者，應向直轄市、縣 (市) 主管機關申請 ，經審查登記，發給排放許可證後，始得排放廢 (污) 水。 前項登記事項有變更時，非於中央主管機關所定期限內辦理變更登記，其 排放廢 (污) 水，不得與原登記事項牴觸。

排放許可證之有效期間為五年。期滿仍繼續使用者，應於期滿六個月前向 直轄市、縣 (市) 主管機關申請核准展延。每次展延，不得超過五年。 前項許可證有效期間內，因水質惡化有危害生態或人體健康之虞時，直轄 市、縣 (市) 主管機關得變更許可事項或撤銷之。

直轄市、縣 (市) 主管機關，得視轄境內水污染狀況，劃定水污染管制區 公告之，並報中央主管機關。 前項管制區涉及二直轄市、縣 (市) 以上者，由中央主管機關劃定並公告 之。

事業或污水下水道系統，排放廢 (污) 水於劃定為總量管制之水體，有左 列情形之一，應自行設置放流水水質水量自動監測系統，予以監測： 一 排放廢 (污) 水量每日超過一千立方公尺者。 二 經直轄市、縣 (市) 主管機關認定係重大水污染源者。 前項監測結果，應作成紀錄，並依規定向直轄市或縣 (市) 主管機關申報 。

廢 (污) 水不得注入於地下水體或排放於土壤。但有左列情形之一，經直 轄市、縣 (市) 主管機關審查核准，發給許可證者，不在此限： 一 污水經處理至規定標準，且不含有害健康物質者，為補注地下水源之 目的，得注入於地下水體。 二 廢 (污) 水經處理至合於土壤處理標準及依第十八條所定之辦法者， 得排放於土壤。 前項第一款之規定標準及有害健康物質之種類、限值，由中央主管機關公 告之。

違反第三十條第一項未經直轄市、縣 (市) 主管機關許可，將含有害健康 物質之廢 (污) 水注入於地下水體或排放於土壤者，處三年以下有期徒刑 、拘役或科或併科新臺幣三萬元以下罰金。

本法所定之處罰，除另有規定外，在直轄市由直轄市政府為之，在縣 (市 ) 由縣 (市) 政府為之。