主計室主任依主計法規之規定，受館長指揮監督，處理歲計、會計及統計事項。

秘書室職掌如下：
一、本館施政計畫、研究發展、管制考核及法制作業等事項。
二、本館業務會報、諮詢委員會議等議事及管考事項、工作報告及大事記彙編等事項。
三、本館對外公共關係業務聯繫及上級機關視察業務簡報等事項。
四、本館志工招募、組訓及運用等統籌事項。
五、本館資訊規劃、推展及運用等統籌事項。
六、本館各項營繕工程之招標、驗收等事項。
七、本館財產管理、員工眷舍及出版品管理等事項。
八、本館採購、水電、空調、消防安全及環境清潔管理等事項。
九、本館印信典守、公文繕校、收發文及檔案管理等事項。
十、本館駕駛、技工、工友及車輛調派管理等事項。
十一、本館員工薪資發放、代收款、所得稅、公勞健保及零用金支付等出納事項。
十二、其他不屬於各組室業務事項。

採集組職掌如下：
一、臺灣文獻採集事項。
二、臺灣古文書採購、整理建檔及出版事項。
三、口述訪談及出版等事項。
四、臺灣地名調查、編輯及出版等事項。
五、地方政府機關（構）擬毀檔案蒐集、檢選事項。
六、碑碣拓本採集、登錄及管理等事項。
七、臺灣民俗文物採集、整理、典藏、研究、展示、推廣、出版、鑑賞、修復及管理等事項
  。
八、其他有關採集業務事項。

整理組職掌如下：
一、文獻檔案點收、整理編目、保存維護、典藏及庫房管理等事項。
二、文獻檔案數位典藏、資料庫系統維護、開放應用、諮詢閱覽及借調等事項。
三、文獻檔案編譯、展示、推廣、研究、出版及學術研討會等事項。
四、圖書、期刊及其他類型資料整理編目、典藏及書庫管理、流通閱覽及圖書系統維護等事
  項。
五、其他有關整理業務事項。

編輯組職掌如下：
一、志書纂修計畫擬定及執行事項。
二、各族群史修纂計畫擬定與執行事項。
三、臺灣早期史料編譯計畫事項。
四、臺灣文獻季刊編輯及出版事項。
五、文獻書刊申請獎勵事項。
六、傑出臺灣文獻獎辦理事項。
七、臺灣文獻專題演講等事項。
八、臺灣史蹟展示、推廣及管理等事項。
九、其他有關編輯業務事項。

人事室掌理本館人事事項。

主計室掌理本館歲計、會計及統計事項。

本館每月舉行業務會報一次，每年舉行擴大業務會報，必要時得舉行臨時會報，由館長召集
之。

本細則自發布日施行。