口腔健康司掌理事項如下：
一、口腔健康政策之規劃、推動及相關法規之研訂。
二、口腔衛生教育及預防保健之規劃及推動。
三、口腔醫療服務體系之規劃、發展及管理。
四、口腔衛生醫事人員管理與人力發展政策之規劃、推動及相關法規之研
  訂。
五、口腔醫事機構管理政策之規劃、推動及相關法規之研擬。
六、口腔醫療品質與病人安全之管理及醫療爭議之處理。
七、口腔醫療科技與國際發展之規劃及推動。
八、其他有關口腔健康事項。

本部設下列司、處：
一、綜合規劃司，分八科辦事。
二、社會保險司，分七科辦事。
三、社會救助及社工司，分四科辦事。
四、護理及健康照護司，分三科辦事。
五、保護服務司，分五科辦事。
六、醫事司，分六科辦事。
七、心理健康司，分五科辦事。
八、中醫藥司，分四科辦事。
九、長期照顧司，分四科辦事。
十、口腔健康司，分三科辦事。
十一、秘書處，分五科辦事。
十二、人事處，分四科辦事。
十三、政風處，分二科辦事。
十四、會計處，分六科辦事。
十五、統計處，分四科辦事。
十六、資訊處，分四科辦事。

心理健康司掌理事項如下：
一、心理健康促進與自殺防治政策之規劃、推動及相關法規之研訂。
二、精神疾病防治與病人權益保障政策之規劃、推動及相關法規之研訂。
三、精神醫療、精神復健機構及其業務之管理。
四、毒品及其他物質成癮防治政策之規劃、推動及相關法規之研訂。
五、家庭暴力、性侵害、性騷擾與老人、身心障礙者、兒童、少年保護事
  件之加害人處遇及預防服務方案之規劃、推動及督導。
六、司法精神醫療政策之規劃、推動及機構醫療業務之管理。
七、其他有關心理健康及精神醫療事項。