泌尿醫學部掌理事項如下：
一、泌尿醫學病人之疾病檢查、診斷及治療。
二、綜理泌尿醫學病人各種疾病之教學、研究及訓練。
三、支援建教合作醫療院所有關泌尿醫學之醫療及教學相關業務。
四、其他有關泌尿醫學醫療事項。

復健醫學部掌理事項如下：
一、復健病人之疾病檢查、診斷及治療。
二、物理、職能、語言、心理治療、職能鑑定等之教學、研究及訓練。
三、支援建教合作醫療院所有關復健醫學之醫療及教學相關業務。
四、其他有關復健醫學醫療事項。

傳統醫學部掌理事項如下：
一、發展中國傳統醫學、整合現代醫學與各國輔助替代醫學之疾病診療、
  教學、研究及訓練。
二、支援建教合作醫療院所有關傳統醫學之醫療及教學相關業務。
三、其他有關傳統醫學醫療事項。

國際醫療中心掌理事項如下：
一、國際醫療、人道醫療援助，並配合執行政府國際醫療政策。
二、綜合辦理國際醫療人員觀摩交流事務。
三、其他有關國際醫療事項。

公共事務室掌理事項如下：
一、公共關係、媒體聯繫及一般文宣事宜；國會聯絡及服務；大事紀、院
  史及院誌編撰；重大事件通報及交辦事項。
二、其他有關公共事務事項。

本院設下列部、中心、科、室：
一、內科部，分九科辦事。
二、外科部，分七科辦事。
三、骨科部，分六科辦事。
四、婦女醫學部，分五科辦事。
五、放射線部，分八科辦事。
六、精神部，分三科辦事。
七、急診部，分五科辦事。
八、眼科部，分四科辦事。
九、耳鼻喉頭頸部，分三科辦事。
十、放射腫瘤部，分二科辦事。
十一、病理檢驗部，分八科辦事。
十二、家庭醫學部，分四科辦事。
十三、麻醉部，分四科辦事。
十四、口腔醫學部，分六科辦事。
十五、重症醫學部，分三科辦事。
十六、泌尿醫學部，分三科辦事。
十七、復健醫學部，分三科辦事。
十八、傳統醫學部，分三科辦事。
十九、藥學部，分三科辦事。
二十、護理部。
二十一、教學部，分二科、二組辦事。
二十二、醫學研究部，分三科辦事。
二十三、醫務企管部，分五組辦事。
二十四、兒童醫學中心，分八科辦事。
二十五、神經醫學中心，分九科辦事。
二十六、心臟血管中心，分六科辦事。
二十七、高齡醫學中心。
二十八、品質管理中心，分三科辦事。
二十九、感染管制中心。
三十、腫瘤醫學中心，分三科辦事。
三十一、國際醫療中心，分二科一組辦事。
三十二、核醫科。
三十三、皮膚科。
三十四、營養室，分二組辦事。
三十五、社會工作室，分二組辦事。
三十六、公共事務室。
三十七、職業安全衛生室。
三十八、工務室，分四組辦事。
三十九、補給室，分三組辦事。
四十、總務室，分三組辦事。
四十一、人事室，分三組辦事。
四十二、政風室，分二組辦事。
四十三、主計室，分四組辦事。
四十四、資訊室，分四組辦事。

醫務企管部掌理事項如下：
一、醫院經營策略規劃、風險管理推動及醫院評鑑等相關業務。
二、門診、住院病人診療與手術醫療之轉介、醫療體系整合、疾病分類、
  醫療資訊與費用分析管理、醫事人員績效管理及研考、企劃作業。
三、其他有關醫務企管事項。

腫瘤醫學中心掌理事項如下：
一、各種腫瘤病人疾病之檢查、診斷及治療；各項腫瘤防治業務之推動、
  稽核及病歷審查。
二、整合各種腫瘤之診療、教學、研究及訓練。
三、支援建教合作醫療院所有關腫瘤之醫療及教學相關業務。
四、其他有關腫瘤醫學醫療事項。

本規程自中華民國一百零六年一月一日施行。
本規程修正條文，自中華民國一百十二年七月一日施行。

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