自然文化景觀由經濟部會同內政部、教育部與交通部審查指定之，並依其特性區分為生態 保育區、自然保留區及珍貴稀有動植物三種。 自然文化景觀喪失或減損其價值時，經濟部得會同內政部、教育部及交通部解除其指定。

自然文化景觀由所在地地方政府或由主管機關指定之機構管理之。

前條自然文化景觀之管理機關或機構，對所管理之自然文化景觀，應造具概況表，並附詳 圖與有關資料層報經濟部存案。生態保育區與自然保留區並應附其所在地之地號、地目及 面積。 前項所報狀況有變更時，應隨時層報。

生態保育區與自然保留區，禁止改變或破壞其原有自然狀態。

珍貴稀有動植物禁止捕獵、網釣、採摘、砍伐或其他方式予以破壞，並應維護其生態環境 。但研究機構為研究、陳列或國際交換等特殊需要，報經主管機關核准者不在此限。

自然文化景觀所在地區域計畫、都市計畫之訂定或變更，應先徵求自然文化景觀主管機關 之意見。 政府機關策定重大營建工程計畫時，應先調查工程地區有無自然文化景觀。