解釋令函

醫療法人得否適用兩稅合一及盈虧互抵之課稅釋疑發文機關：財政部賦稅署
發文字號：財政部賦稅署 95.07.13. 臺稅一發字第09504526550號函
發文日期：民國95年7月13日主旨：有關醫療法人得否適用兩稅合一及盈虧互抵之課稅疑義乙案。
說明：
二、依醫療法第 5條規定，本法所稱醫療法人，包括醫療財團法人及醫療社團法人。所稱
醫療財團法人，係指以從醫療事業辦理醫療機構為目的，由捐助人捐助一定財產，經
中央主管機關許可並向法院登記之財團法人。所稱醫療社團法人，係指以從事醫療事
業辦理醫療機構為目的，經中央主管機關許可登記之社團法人。
三、上開醫療財團法人，依其性質係屬所得稅法第11條第 4項規定之教育、文化、公益慈
善機關或團體，依所得稅法第 4條第 1項第13款規定，如符合行政院發布之教育文化
公益慈善機關或團體免納所得稅適用標準者，其本身之所得及附屬作業組織所得，除
銷售貨物或勞務之所得，應依上開免稅標準第 3條第 1項規定課徵所得稅外，免納所
得稅；其銷售貨物或勞務之虧損，依財政部84年 3月 1日台財稅第 841607554號函規
定，可比照公司組織之營利事業，如符合所得稅法第39條但書規定，得自以後 5年（
編者註：現為10年）度銷售貨物或勞務之所得中扣除。
四、另依所得稅法第66條之 1第 2項第 3款規定，上開醫療財團法人，免設置股東可扣抵
稅額帳戶，尚無兩稅合一制之適用，故其投資於國內其他營利事業所獲配之股利淨額
或盈餘淨額，依同法第42條第2 項規定，不計入所得額課稅，其可扣抵稅額，不得扣
抵其應納所得稅額，並不得申請退還。
五、至於醫療社團法人部分，依醫療法第49條第 3項規定，其得於章程中明定，社員按其
出資額，保有對法人之財產權利，並得將其持分全部或部分轉讓於第三人。依此，醫
療社團法人之結餘可按出資比例分配予其社員，具有營利之性質，應屬所得稅法第11
條第 2項規定，以其他組織方式成立之營利事業。該法人應依一般營利事業適用所得
稅法有關兩稅合一規定，且可比照公司組織之營利事業，適用同法第39條但書有關前
5年虧損扣抵之規定。

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