本條例所稱主管機關：在中央為行政院農業委員會；在直轄市為直轄市政府；在縣 （市）為縣（市）政府。 本條例所稱動物防疫機關，係指各級主管機關依第八條第二項所設之機關及鄉（鎮 、市）公所。 主管機關對於主管事項涉及國民健康者，應會同衛生主管機關行之。

本條例所稱動物傳染病，由中央主管機關依傳染病危害之嚴重性，分為甲、乙、丙 三類公告之。 直轄市或縣（市）主管機關為防治動物傳染病之發生、傳染及蔓延，得以命令指定 前項以外之動物傳染病，並適用本條例之一部或全部。

各級主管機關應置動物防疫人員，由具獸醫師資格者任之。 直轄市、縣（市）政府應設動物防疫機關；中央主管機關應設動物防疫檢疫機關， 必要時得設中央獸醫研究所。 輸出入動物檢疫機關，應置動物檢疫人員，由具獸醫師資格者任之。各級主管機關 為緊急防治動物傳染病，得調派轄內動物防疫人員或動物檢疫人員，施行緊急防治 。

動物所有人或管理人，於其動物因罹患或疑患動物傳染病或病因不明而死亡時，應 向動物防疫機關報告；如在運輸中，應由運輸業者，向最初停止地之動物防疫機關 報告。各該動物防疫機關接到報告時，應即派遣動物防疫人員前往驗屍，並指示燒 燬、掩埋、消毒及其他必要處置。動物所有人或管理人要求時，應發給處置證明書 。 屬於家庭副業之雞、火雞、鴨、鵝及其血緣相近之野生動物病死，數量在十隻以下 者，其所有人得自行處理，不適用前項規定。但如遇動物傳染病流行時，直轄市或 縣（市）主管機關得分區指定動物傳染病名稱及動物種類，隨時公告依前項規定處 理，並應報請中央主管機關核備。

直轄市或縣（市）主管機關，為防治動物傳染病之發生，得令動物防疫人員施行動 物生體檢查、預防注射、投與疫苗、藥浴或投藥，對已執行之動物或場所得附加記 號或標示等防治措施。 動物所有人或管理人應依動物防疫人員之指示，控制動物之行動及提供其他必要協 助，並不得拒絕，亦不得故意破壞、偽造前項記號或標示。 直轄市或縣（市）主管機關施行動物生體檢查、預防注射、投與疫苗、藥浴或投藥 ，得收取工本費，其收費標準由直轄市或縣（市）主管機關定之。 直轄市或縣（市）主管機關應於施行第一項措施十日前，將施行目的、日期、區域 、方法及動物種類等有關事項先行公告。但因緊急情況時，得縮短其公告時間或隨 時施行之。 為清除特定之動物傳染病，中央主管機關得公告其使用疫苗之種類及管理辦法。

動物防疫機關於動物傳染病發生後有迅速蔓延之虞時，應迅即陳報其上級主管機關 ，並通知鄰近及與動物之集散有關之直轄市或縣（市）政府。

各級主管機關認為防疫上有必要時，得採取左列各項措施： 一、指定區域禁止或限制輸送一定種類之動物，並停止搬運可能傳播動物傳染病病 原體之動物屍體及物品。但其限期不得超過一年。 二、指定區域停止檢疫物之輸入。 三、在交通要道設置檢疫站施行檢查，並得準用第三十四條第一項及第三十五條之 規定。 直轄市或縣（市）主管機關執行前項各款規定時，應將經過情形報請中央主管機關 備查，並通知有關鄰近地區主管機關。

直轄市或縣（市）主管機關認為防疫上有必要時，得令動物園、屠宰場、家畜（肉 品）市場、家禽市場、魚市場、畜產及水產加工廠、孵化場、人工授精站、集乳站 等場所停止營業，並禁止辦理動物比賽會、賽馬會及其他動物聚集之活動。

中央主管機關認為必要時，得派所屬動物防疫人員，主持縣（市）與縣（市）或縣 （市）與直轄市間之動物傳染病聯合防疫，或協助直轄市、縣（市）主管機關辦理 動物傳染病防疫事宜。

直轄市或縣（市）主管機關於動物傳染病消滅時，應將限制措施公告撤銷及報請中 央主管機關備查，並通知鄰近地區主管機關。

依本條例規定，由動物防疫人員施行生體檢查、預防注射、投與疫苗、藥浴或投藥 而致死或流產，或撲殺之動物及銷燬之物品，除其所有人或管理人違反本條例或其 他法令之規定者不予補償外，該管直轄市、縣（市）主管機關應組織評價委員會， 評定其價格，並依左列標準發給補償費： 一、健康動物因生體檢查、預防注射、投與疫苗、藥浴或投藥等措施致死或流產之 屍體，依評價額以內補償之。 二、因疑患或可能感染動物傳染病所撲殺之動物，依評價額以內補償之。 三、為鑑定病因而撲殺之動物，依評價額以內補償之。 四、罹患動物傳染病所撲殺之動物，依評價額五分之三以內補償之。 五、銷燬之物件，依評價額二分之一以內補償之。 六、為控制動物傳染病，經主管機關同意送往屠宰場屠宰者，依評價額扣除實際銷 售額之差價全額補償之。 前項評價委員會之組成人員及評價標準，由中央主管機關定之。 輸出入檢疫時依第一項第二款至第五款處理之動物或物品，或隔離留檢期間死亡之 動物，不發給補償費。 第一項各款補償費，由直轄市或縣（市）主管機關負擔。但中央主管機關得予補助 。