- 中華民國107年12月21日行政院環境保護署環署水字第1070103726號令修正發布第三條、第四條、第七條、第十五條、第十六條、第二十條；增訂第四條之一、第四條之二、第十條之一；刪除第十四條條文
- 中華民國106年12月27日行政院環境保護署環署水字第1060103989號令修正發布新增第十三條之一、第十三條之二條文
- 中華民國104年11月24日行政院環境保護署環署水字第1040095813E號令修正發布全文二十四條，自發布日施行
- 中華民國95年4月14日行政院環境保護署環署水字第0950028185Ｃ號令修正發布第十二條；增訂第九條之一；刪除第十五條條文
- 中華民國92年7月30日行政院環境保護署環署水字第0920053613號令修正發布全文十六條
- 中華民國90年8月8日行政院環境保護署(90)環署水字第0046268號令修正發布第二十一條條文
- 中華民國88年9月22日行政院環境保護署（88）環署水字第0060315號令修正發布第二條、第三條、第五條、第六條、第十五條、第二十四條、第二十九條、第三十九條、第四十條條文
- 中華民國87年8月12日行政院環境保護署（87）環署水字第0051132號令修正發布第十五條、第二十三條、第三十二條、第三十四條之一、第四十一條條文
- 中華民國86年4月23日行政院環境保護署（86）環署水字第19861號令修正發布第三條、第十四條、第三十條之一、第三十四條之一、第五十二條之一、第六十四條條文
- 中華民國83年5月25日行政院環境保護署環署水字第21005號令修正發布第十三條、第四十四條條文
- 中華民國81年12月7日行政院環境保護署環署水字第53828號令修正發布
- 中華民國73年5月18日行政院衛生署衛署環字第482612號令修正發布
- 中華民國64年5月29日經濟部經法字第12081號令訂定發布