業務一組掌理事項如下： 一、進口、郵遞貨物之通關。 二、進口稅則預先審核及疑義案件之處理。 三、進口貨物補稅、免稅、押款、退款、按月彙繳、先放後稅、分期繳納關稅、暫准通關 案件及艙單之處理。 四、進口報單審核、副本核發及貨物稅完（免）稅證明書之處理。 五、進口貨物退運、調換、聲明放棄之處理。 六、進出口貨物查驗及貨樣之管理。 七、進口報單管理。 八、違章及行政救濟案件之處理。 九、其他有關進口通關、進出口貨物查驗及稽核事項。

機動儀檢組掌理事項如下： 一、進口、出口、轉運、轉口貨櫃（物）之抽核、複驗及儀器檢查。 二、入出境旅客、航（船）員行李、郵遞貨物之抽核及複驗。 三、情資蒐集、分析及市面查緝。 四、貨棧、貨櫃集散站、私貨倉庫、免稅商店及保稅相關處所貨物之抽核。 五、電子封條監控系統之管理及維護。 六、貨櫃檢查儀、輻射偵測儀等查緝設備之管理及維護。 七、輻射證照人員、儀器操作人員之訓練及管理。 八、事後稽核案件之處理。 九、緝毒犬隊執勤（搜索、偵測）及管理。 十、其他有關機動查緝及儀檢事項。

本細則自中華民國一百零二年一月一日施行。 本細則修正條文自發布日施行。